CAT#:JW-15-41000
低温运输,-20℃保存
产品及特点
恙虫病东方体(Orientia tsutsugamsushi)属立克次体科东方体属,为革兰阴性专性胞内寄生的杆菌。恙虫病东方体是恙虫病的病原体,该病主要通过恙螨幼虫叮咬而传播,是一种自然疫源性疾病,是由恙虫病东方体引起的一种未分化的急性发热性疾病,是一种复发性感染。对于恙虫病病人来说,它是一种抗生素可治愈的疾病,但是容易误诊,如不加适当的治疗,病死率可达30%~50%,给人类健康造成极大危害。因此恙虫病东方体的快速检测具有重要意义,为此本公司以探针法qPCR技术为基础开发了恙虫病东方体的检测试剂盒,它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供样品DNA模板。
2.引物和探针经过优化,灵敏度高,最低检测限可达100拷贝/反应。
3.提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4.特异性高,引物是根据恙虫病东方体基因组DNA高度保守区设计,不会跟其它生物的DNA发生交叉反应。
5.既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时,线性范围至少5个数量级。
6.本产品足够50次20 μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
7.本产品只能用于科研。
规格及成分
本产品使用五孔盒包装
成分 编号 规格 包装
2×Probe qPCR MasterMix 981201 500 μL 0.5 mL本色盖
荧光PCR专用模板稀释液 180701 1 mL 1.5 mL绿盖管
超纯水 210806 1 mL 1.5mL蓝盖管
恙虫病东方体qPCR
引物-探针干粉 yp15-41000 50 次 0.5 mL棕色管
恙虫病东方体阳性对照
(1E7拷贝/μL) pc41000-HQ660204 50 μL 0.5 mL黄盖管
使用手册 sc15-41000 1 份 1 份
注意:引物-探针干粉在使用前需要离心,然后在离心管中加入165 mL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为24个月。
自备物品
超纯水,样品DNA。
使用方法
一、稀释标准曲线样品(以1E1-1E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。
由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能
污染样品或本试剂盒的其他成分。本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供DNA片段作为阳性对照。
1.标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
2.用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头(下同)。
3.在6号管中加入5 μL 1E7拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡混匀1分钟,得到1E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4.换枪头,在5号管中加入5 μL 1E6拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡混匀1分钟,得到1E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5.换枪头,在4号管中加入5 μL 1E5拷贝/μL的阳性对照(上步所得),充分震荡混匀1分钟,得到1E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6.依次重复上面的操作得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品DNA的制备
7.如果有N个样品,最好设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 μL上步所得4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。
8.用自选方法纯化样品的DNA,本试剂盒跟市场上大多数样品DNA提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、qPCR 反应(20 μL体系,在样品制备室进行)
9.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设
置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
成分 样品管N+3个 PCR阴性对照管 标曲样品管(1-6)
2×Probe qPCR
MasterMix 各10 μL 10 μL 各10 μL
恙虫病东方体qPCR
引物-探针混合液 各3 μL 3 μL 各3 μL
待测样本DNA模板 7 μL 不加 不加
超纯水 不加 7 μL 不加
第6步所得标准曲线样品稀释液(1-6号) 不加 不加 各7 μL(1号样到1号管,2号样到2号管…)
11.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
过程 温度 时间
预变性 95℃ 5 min
PCR反应
(45个循环) 95℃ 30 sec
55℃ 30 sec
72℃ 30 sec
(采集FAM通道,淬灭基团为BHQ)
四、数据处理
12.如果扩增阳性对照或制备阳性对照结果为阴性,则整个扩增或制备实验无效,不需要分析数据,需要重做扩增或制备或跟厂家联系。如果扩增阴性对照或制备阴性对照结果为阳性,说明环境污染,则整个扩增或制备实验无效,不需要分析数据,需要跟厂家联系,购买新的引物和探针。
13.如果阴性对照和阳性对照正常,则实验有效,可以进入后续分析。
14.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。
15.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照必须无Ct或Ct大于或等于45。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于45,否则实验无效。如果实验有效,则分析待测样品,如果无Ct或Ct大于或等于45,则为阴性。如果Ct小于45则为阳性。
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