CAT#:JW-15-030-PrP
低温运输,-20℃保存
牛朊病毒蛋白mRNA探针法qRT-PCR检测试剂盒
产品及特点
牛朊病毒蛋白(Bos taurus Prion Protein)是牛朊病毒疾病的致病因子,它由阮病毒基因(Prion Protein Gene,PRNP)编码,在朊病毒疾病的致病机制中起到至关重要的作用。己有的研究证实包括人在内的动物对朊病毒疾病的易感性与PRNP基因的多态性相关。牛朊病毒蛋白影响朊病毒的致病性及传播,因此快速检测牛朊病毒蛋白具有重要意义。本产品是以探针法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测牛朊病毒蛋白mRNA的试剂盒,它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供样品RNA模板。
2.引物和探针经过优化,分析灵敏性高,可以达到100拷贝/反应。
3.提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4.特异性高,引物是根据牛朊病毒蛋白mRNA高度保守区设计,不会跟其他病原菌的RNA发生交叉反应。
5.既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为5
个数量级。
6.本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
7.本产品只能用于科研。
规格及成分
成分 编号 规格 包装
探针法qRT-PCR缓冲液 990504a 0.5 mL 0.5 mL蓝盖管
探针法qRT-PCR酶混合液v2 990504bv2 50 μL 0.5 mL红盖管
荧光PCR专用模板稀释液 180701 1 mL 1.5 mL绿盖管
牛朊病毒蛋白mRNA探针法引物-探针干粉 yp030-PrP 50 次 0.5 mL棕色管
牛朊病毒蛋白mRNA阳性对照(1×10E7拷贝/μL) pc15-030-PrP-xj 50 μL 0.5 mL黄盖管
使用手册 15-030-PrPsc 1份 无
本产品采用五孔盒包装
注意:引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入165μL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。
自备物品
样品RNA。
使用方法
一、稀释标准曲线样品(以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
1.标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。
2.用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
3.在6号管中加入5 μL 1×10E7拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4.换枪头,在5号管中加入5 μL 1×10E6拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5.换枪头,在4号管中加入5 μL 1×10E5拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6.重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
7.如果有N个样品,最好设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 μL上步所得4号稀释液再加上一定量的水使总体积跟核酸制备试剂盒所要求的起始样本体积一样,以此作为PC。另外用水作为NC。
8.用自选方法纯化样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒RNA提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、Probe qRT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
9.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析并且只做1次重复,则标记N+4个RT-PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-PCR阴性对照(用水做模板),1个用于RT-PCR阳性对照(直接用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
成分 样品管N+2个 RT-PCR阴性对照管 标曲样品管(1-6管)
探针法qRT-PCR缓冲液 各10 μL 10 μL 各10 μL
探针法qRT-PCR酶混合液 各2 μL 2 μL 2 μL
牛朊病毒蛋白mRNA RT-PCR引物-探针混合液 各3 μL 3 μL 各3 μL
待测样品RNA模板 各5 μL 不加 不加
超纯水 不加 5 μL 不加
第6步所得标准曲线样品稀释液(1-6号) 不加 不加 各5μL(2号样到2号管,3号样到3号管…)
11.盖上盖子后上机,按下面参数进行RT-PCR:
过程 温度 时间
逆转录 50℃ 15 min
预变性 95℃ 5 min
PCR反应
(40个循环) 95℃ 15 sec
60℃ 60sec(采集FAM通道的荧光信号,淬灭基团为BHQ1)
四、数据处理
12.如果扩增阳性对照或制备阳性对照结果为阴性,则整个扩增或制备实验无效,不需要分析数据,需要重做扩增或制备或跟厂家联系。如果扩增阴性对照或制备阴性对照结果为阳性,说明环境污染,则整个扩增或制备实验无效,不需要分析数据,需要跟厂家联系,购买新的引物和探针。
13.如果阴性对照和阳性对照正常,则实验有效,可以进入后续分析。
14.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。
15.如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照必须无Ct或Ct大于或等于35。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于35,否则实验无效。如果实验有效,则分析待测样品,如果无Ct或Ct大于或等于35,则为阴性。如果Ct小于35则为阳性。
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