CAT#:JW-14-24820
低温运输,-20℃保存
诺如病毒G2型染料法qRT-PCR试剂盒
产品及特点
诺如病毒(Norwalk Viruses,NV)是人类杯状病毒科(Human Calicivirus, HuCV)中诺如病毒(Norovirus, NV)属的一种病毒。NV是引起儿童和成人非细菌性急性胃肠炎的重要病因,主要通过粪-口途径传播,与饮用水和食物尤其是贝类的污染密切相关。NV感染性腹泻在全世界范围内均有流行,全年均可发生感染,感染对象主要是成人和学龄儿童,寒冷季节呈现高发。美国每年在所有的非细菌性腹泻暴发中,60-90%是由NV引起。荷兰、英国、日本澳大利亚等发达国家也都有类似结果。在中国5岁以下腹泻儿童中,NV检出率为15%左右,血清抗体水平调查表明中国人群中诺如病毒的感染亦十分普遍。该病毒是一组形态相似、抗原性略有不同的RNA病毒,分为G(I-V)五型,感染人的有GI、GII和GIV型,其中以GII型最为常见。NV是引起儿童和成人非细菌性急性胃肠炎的重要病因,没有疫苗和特效药物,因此灵敏快捷的诊断产品NV-2型病毒具有重要的意义。本产品基于染料法qRT-PCR原理开发。它具有下列特点:
1.一站式,用于不需要单独准备每种成分,只需要提供RNA样品。
2.基于染料法qRT-PCR检测,灵敏度比常规RT-PCR高10-100倍,可以达到至少100拷贝/反应。
3.根据诺如病毒G2型的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性,不会跟其它生物的RNA发生交叉反应。
4.使用一管式qRT-PCR技术,RT和PCR两步在一个试管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。
5.本产品既可用于定性检测,也可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少有5个数量级。
6.本产品足够50次20μL体系的RT-PCR反应
7.只能用于科研,不能用于临床。
规格及成分
本产品采用五孔盒包装
成份 编号 规格 包装材料
2×SYBR qRT-PCR 缓冲液 990102a 500 μL 0.5mL本色管
10×SYBR qRT-PCR酶混合液 990102b 100 μL 0.5mL红盖管
荧光PCR专用模板稀释液 180701 1 mL 1.5mL绿盖管
诺如病毒G2型qRT-PCR引物干粉 yw15-24820tm 50次 0.5mL白盖管
诺如病毒G2型qRT-PCR阳性对照(1×10E7拷贝/μL) pc15-24820tm 50 μL 0.5mL黄盖管
使用手册 14-24820sc 1份 无
注意:引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入110uL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。阳性对照需要单独放置。
自备试剂
样品RNA
使用方法
一、稀释阳性对照(以10E1-10E6这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。
1.标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。用带芯枪头分别加入45 μL 荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
2.换枪头,在6号管中加入5 μL 1×10E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1×10E6拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
3.换枪头,在5号管中加入5 μL 1×10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E5拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
4.换枪头,在4号管中加入5 μL 1×10E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1×10E4拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
5.重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
6.如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10μL上得到的阳性对照梯度稀释液中的第4号(浓度为1×10E4拷贝/μL,10μL相当于1万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照(加水后其总体积跟核酸纯化试剂盒所要求的样本起始体积一样)。可以用水作为制备的阴性对照。
7.用自选方法纯化N+2个样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒样品RNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、设置RT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
8.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
9.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分 N+2个制备所得样品 RT-PCR阴性对照 RT-PCR阳性对照(1-6管)
2×SYBR qRT-PCR 缓冲液 10μL 10μL 各10μL
诺如病毒G2型qRT-PCR引物混合液 2μL 2μL 各2μL
N+2个RNA模板 6μL 不加 不加
自备超纯水 不加 6μL 不加
6个阳性对照稀释液 不加 不加 各6μL(2号样到2号管,3号样到3号管…)
10×SYBR qRT-PCR酶混合液 2μL 2μL 2μL
10.上机后按下面参数进行RT-PCR。
过程 温度 时间
RT(逆转录) 50℃ 30分钟
预变性 95℃ 2分钟
PCR反应
(35个循环) 95℃ 15 秒
60℃ 15 秒(采集SYBR通道的荧光信号)
72℃ 15 秒
按仪器预设程序进行溶解曲线分析
注意:循环次数最好不要超过35次。
四、数据处理
11.通过溶解曲线分析的结果排除无效数据。有Ct值,但Tm值跟阳性对照Tm不一样的样品(包括对照和待测样品),归为假阳性,数据无效,不予以分析。Tm跟阳性对照Tm一致的,为有效Ct。
12.如果两种阴性对照的溶解曲线所得Tm值跟阳性对照的Tm值一样,说明环境或试剂可能有过去的qRT-PCR扩增产物污染,则此次实验无效,需要解决污染问题再进行实验。
13.如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和qRT-PCR阴性对照)是假阳性,可以继续分析其它样品有效数据。
14.对定量检测,以阳性对照样品的浓度的log值为横轴,以有效Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的有效Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再换算出待测样品的RNA浓度。
15.对定性检测,则有有效Ct值的为阳性,无有效Ct值的为阴性。
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