CAT#:JW-14-15911
低温运输,-20℃保存
甲型流感病毒N11亚型染料法qRT-PCR试剂盒
产品及特点
甲型流感病毒(Influenza Virus A)属于正黏病毒科,其基因组由8个节段的单股负链RNA组成,长度约为136,000 nt。甲型流感病毒亚型众多,能感染多种宿主,其中N11亚型是最近在蝙蝠中新鉴定出的一种亚型。该亚型在蝙蝠中长期独立进化,扩大了流感病毒宿主范围。由于该亚型的宿主蝙蝠被称作“迁徙病毒库”,因此甲型流感病毒N11亚型的快速灵敏诊断具有重要的公共卫生学意义。本产品基于PCR原理开发,专门用于检测甲型流感病毒N11亚型。它具有下列特点:
1.一站式,用于不需要单独准备每种成分,只需要提供RNA样品。
2.基于染料法qRT-PCR检测,灵敏度比常规RT-PCR高10-100倍,可以达到至少100拷贝/反应。
3.根据甲型流感病毒N11亚型的保守基因序列设计的引物,具有良好的特异性,不会跟其它生物的RNA发生交叉反应。
4.使用一管式qRT-PCR技术,RT和PCR两步在一个试管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。
5.本产品既可用于定性检测,也可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少有5个数量级。
6.本产品足够50次20 μL体系的RT-PCR反应
7.本产品只能用于科研。
规格及成分
成份 编号 规格 包装
2×SYBR qRT-PCR 缓冲液 990102a 500 μL 0.5 mL本色管
10×SYBR qRT-PCR酶混合液v2 990102bv2 100 μL 0.5 mL红盖管
荧光PCR专用模板稀释液 180701 1 mL 1.5 mL绿盖管
甲型流感病毒N11亚型RT-PCR引物混合液 yw14-15911 100 μL 0.5 mL白盖管
甲型流感病毒N11亚型RT-PCR阳性对照(1E7拷贝/μL) pc14-15911 50 μL 0.5 mL黄盖管
使用手册 14-15911sc 1份 无
本产品采用五孔盒包装
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。阳性对照需要单独放置。
自备试剂
样品RNA
使用方法
一、稀释阳性对照(以1E1-1E6这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原。
1.标记6个离心管,分别为6,5,4,3,2,1。用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
2.换枪头,在6号管中加入5 μL 1E7拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1E6拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
3.换枪头,在5号管中加入5 μL 1E6拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E5拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
4.换枪头,在4号管中加入5 μL 1E5拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E4拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
5.重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
6.如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 μL上步制备的阳性对照梯度稀释液中的第4号(浓度为1E4拷贝/μL,10 μL相当于1万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照,加水后其总体积跟核酸纯化试剂盒所要求的起始样品体积一样。可以用水作为核酸制备的阴性对照NC。
7.用自选方法纯化N+2个样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒样品RNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、设置RT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
8.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
9.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分 N+2个制备所得样品 RT-PCR阴性对照 RT-PCR阳性对照(1-6管)
2×SYBR qRT-PCR 缓冲液 10 μL 10 μL 各10 μL
甲型流感病毒N11亚型qRT-PCR引物混合物 2 μL 2 μL 各2 μL
N+2个RNA模板 6 μL 不加 不加
自备超纯水 不加 6 μL 不加
6个阳性对照稀释液 不加 不加 各6 μL(2号样到2号管,3号样到3号管…)
10×SYBR qRT-PCR酶混合液v2 1 μL 1 μL 1 μL
10.上机后按下面参数进行RT-PCR(参数可能会因仪器不同而需优化)。
过程 温度 时间
RT(逆转录) 50℃ 30分钟
预变性 95℃ 2分钟
RT - PCR反应
(35个循环) 95℃ 15 秒
60℃ 15 秒(采集SYBR通道的荧光信号)
72℃ 15 秒
按仪器预设程序进行溶解曲线分析
注意:循环次数最好不要超过35次。
四、数据处理
11.通过溶解曲线分析的结果排除无效数据。有Ct值,但Tm值跟阳性对照Tm不一样的样品(包括对照和待测样品),归为假阳性,数据无效,不予以分析。Tm跟阳性对照Tm一致的,为有效Ct。
12.如果两种阴性对照的溶解曲线所得Tm值跟阳性对照的Tm值一样,说明环境或试剂可能有过去的qRT-PCR扩增产物污染,则此次实验无效,需要解决污染问题再进行实验。
13.如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和qRT-PCR阴性对照)是假阳性,可以继续分析其它样品有效数据。
14.对定量检测,以阳性对照样品的浓度的log值为横轴,以有效Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的有效Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再换算出待测样品的RNA浓度。
15.对定性检测,则有有效Ct值的为阳性,无有效Ct值的为阴性。
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猴D型逆转录病毒染料法RT-PCR试剂盒