CAT#:JW-14-1580
低温运输，-20℃保存

柑橘黄龙病菌亚洲种染料法PCR试剂盒

产品及特点
柑橘黄龙病菌亚洲种（Candidatus Liberobacter Asiaticum）是一种类菌体，柑桔感染黄龙病后，全年均可发生，一般以夏梢和秋梢发病最多，其次是春梢。新梢的症状是叶片表现黄化和黄绿相间的斑驳。在叶片凋落后，枝梢上新长出的叶片表现缺素状的花叶。病梢变短、生势衰弱，病叶黄厚、变小，且易脱落，形成枯枝。开花不适时，花开的多、落得多。果小而畸形，或红鼻果。后期，根部往往表现为小根腐烂。此菌可以侵染芸香科柑橘属和金橘属植物，引发症状。通过菟丝子，此菌可以侵染长春花。在自然界，芸香科蚝壳刺属和木苹果属植物可能受此菌侵染，九里香属植物常见着生大量传播柑橘黄龙病的柑橘木虱，但其体内未见病原菌。由于其危害较大，因此快速准确检测柑橘黄龙病菌亚洲种具有重要的意义，本产品就是以染料法荧光定量PCR技术为基础开发的专门检测柑橘黄龙病菌亚洲种的试剂盒，它具有下列特点：
1.即开即用，用户只需要提供样品DNA模板。
2.引物经过优化，灵敏性高，分析灵敏度可以达到100拷贝/反应。
3.提供阳性对照，便于区分假阴性样品。
4.特异性高，引物是根据柑橘黄龙病菌亚洲种高度保守区设计，不会跟其他生物的DNA发生交叉反应。
5.本产品足够50次20μL体系的染料法荧光定量PCR反应。
6.既可用于定性，也可用于定量。用于定量时线性范围至少5个数量级。
7.本产品只能用于科研。

规格及成分
本产品采用五孔盒包装
成分                                                                                 编号               规格           包装材料
2×SYBR qPCR MasterMix                                           990408              0.5 mL    0.5mL本色盖
荧光PCR专用模板稀释液                                            180701               1 mL      1.5mL绿盖管
超纯水                                                                           210806              1 mL     1.5mL蓝盖管
柑橘黄龙病菌亚洲种染料法qPCR引物干粉                   yw15-1580zw    50次      0.5mL白盖管
柑橘黄龙病菌亚洲种PCR阳性对照 (1×10E7拷贝/μL)    pc15-1580zw    50 μL     0.5mL黄盖管
使用手册                                                                        14-1580sc         1份            无
注意：引物干粉在使用前需要短暂离心，然后在离心管中加入110uL的超纯水充分混匀后再使用，未用完的需要-20℃保存。

运输及保存
低温运输，-20℃保存，保存期限为24个月。

自备试剂
样品DNA。

使用方法
一、稀释标准曲线样品（以10E1-10E6拷贝/μL这6个10倍稀释度为例）。由于标准品浓度非常高，因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行，千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分）。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原，本产品不提供活体样品做阳性对照，只提供无传染性的DNA片段作为阳性对照。
1.标记6个离心管，分别为6，5，4，3，2，1。
2.用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液，最好用带芯枪头，下同）。
3.在6号管中加入5 μL 1×10E7拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供)，充分震荡1分钟，得1×10E6拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
4.换枪头，在5号管中加入5 μL 1×10E6拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡1分钟，得1×10E5拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
5.换枪头，在4号管中加入5 μL 1×10E5拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡1分钟，得1×10E4拷贝/μL的标准曲线样品。放冰上待用。
6.重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。

二、样品DNA的制备
7.如果有N个样品，最好设置N+2个提取，多出的一个是PC（样品制备阳性对照），一个是NC（样品制备阴性对照）。可以用10μL第6步所得的第4号稀释液（1×10E4拷贝/μL）再加上一定量的水使总体积跟核酸纯化试剂盒所要求的起始样本体积一样，以此作为PC。另外用水作为NC。
8.用自选方法纯化样品的DNA，本试剂盒跟市场上大多数样品DNA提取试剂盒兼容，也可使用本公司的免提取核酸释放剂。

三、染料法qPCR反应（20μL体系，在样品制备室进行）
9.如果做定量分析并且只做1次重复，则标记N+9个PCR管，其中N+2个用于上步得到的N+2个样品，1个用于PCR阴性对照（用水做模板），6个用于标准曲线。如果做定性分析，并且只做1次重复，则标记N+4个PCR管，其中N+2个用于上步得到的N+2个样品，1个用于PCR阴性对照（用水做模板），1个用于PCR阳性对照（用第6步第4号管的阳性对照稀释液做模板）。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
10.在标记管中按下表加入各成分（本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照，并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加）：
成分                                                           样品管N+2个    PCR阴性对照管    标准曲线样品管（1-6管）
2×SYBR qPCR MasterMix                               10 μL               10 μL                   各10 μL
柑橘黄龙病菌亚洲种染料法qPCR引物混合液   2 μL                 2 μL                    各2 μL
 N+2个待测DNA模板                                         8 μL                不加                    不加
超纯水                                                               不加                8 μL                     不加
第6步所得标准曲线样品稀释液（1-6号）         不加                不加           各8μL（2号样到2号管，3号样到3号管…）
11.盖上盖子后上机，按下面参数进行PCR：
过程                    温度    时间
预变性                95℃    1 min
PCR反应
（35个循环）     95℃    15 sec
                           59℃    15 sec（采集SYBR通道的荧光信号）
溶解曲线分析        按qPCR仪器手册执行
注意：循环次数不要超过35个循环。

四、数据处理
12.通过溶解曲线分析的结果排除无效数据。有Ct值，但Tm值跟阳性对照Tm不一样的样品（包括对照和待测样品），归为假阳性，数据无效，不予以分析。Tm跟阳性对照Tm一致的，为有效Ct。
13.如果两种阴性对照的溶解曲线所得Tm值跟阳性对照的Tm值一样，说明环境或试剂可能有过去的PCR扩增产物污染，则此次实验无效，需要解决污染问题再进行实验。
14.如果两种阴性对照（样品制备阴性对照和PCR阴性对照）是假阳性，可以继续分析其它样品有效数据。
15.对定量检测，以阳性对照样品的浓度的log值为横轴，以有效Ct值为纵轴，绘制标准曲线。再以待测样品的有效Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值，再换算出待测样品的DNA浓度。
16.对定性检测，则有有效Ct值的为阳性，无有效Ct值的为阴性。

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