CAT#:JW-990504
低温运输,-20℃保存
探针法qRT-PCR试剂盒
产品及特点
本产品是基于荧光探针检测的即用型RT-PCR试剂盒,可以对靶RNA分子进行实时定量RT-PCR分析(quantitative RT-PCR、qRT-PCR)。产品含有经过优化的缓冲液组分、逆转录酶、热启动Taq DNA聚合酶、Taq DNA稳定剂、dNTPs、MgCl2和稳定剂等所有实时定量RT-PCR所需要的成分,用户只需加入RNA模板、引物和探针即可进行探针法实时定量RT-PCR反应,具有广泛的用途。本产品具有下列特点:
1.以2×Mix提供,用户只需准备模板、引物、探针和ROX染料(取决于qPCR仪器)即可以进行探针法实时定量RT-PCR实验,非常方便快捷,降低了操作误差。
2.各成分的浓度和比例都经过精心优化,反应的灵敏度高,特异性强。灵敏度最高时可以达到50拷贝/反应(跟模板质量,引物设计等相关)。
3.既可用于TaqMan探针qRT-PCR,也可以是分子信标(molecular beacon)的qRT-PCR。
4.灵敏度和专一性比染料法荧光定量RT-PCR更高。
5.可用于基因表达分析、SNP分析、拷贝数分析等实验。也可以用于定性检。
6.本产品只能用于科研,1 mL足够100次20 μL体系的探针法qRT-PCR反应。
规格及成分
本产品采用塑料袋包装
成分 编号 规格 包装材料
探针法qRT-PCR缓冲液 990504a 500 μL 0.5 mL蓝盖管
探针法qRT-PCR酶混合液 990504b 100 μL 0.5 mL红盖管
使用手册 990504sc 1份 1份
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。
自备试剂
RNA模板、引物、TaqMan探针、超纯水。
使用方法
一、如果有N个样品并且做定量分析,最好设置N+7个反应,多出的7个中,6个是做标准曲线的阳性对照,一个是阴性对照(NC)。在N+7个PCR管中,加入下列成分。如果是做定性分析,则6个做标准曲线的样品缩减成一个阳性对照(PC),用户自己需要根据下表进行适当修改(把6个标曲反应改成1个阳性对照反应)。
成分 N个样品管 6个标准曲线管 NC管
探针法qRT-PCR缓冲液 各10 μL 10 μL 10 μL
自备引物1(10 μM) 各1 μL 各1 μL 1 μL
自备引物2(10 μM) 各1 μL 各1 μL 1 μL
N个自备模板RNA 各1-2 μL 不加 不加
自备阳性对照模板(6个梯度) 不加 各1 μL(1管加1个梯度) 不加
阴性对照模板(水) 不加 不加 1 μL
自备探针(5 μM) 各1 μL 各1 μL 1 μL
自备50×ROX I染料或自备50×ROXII染料(见注) 各0.4 μL 各0.4 μL 0.4 μL
探针法qRT-PCR酶混合液 2 μL 2 μL 2 μL
补超纯水到 20 μL 20 μL 20 μL
注,下列信息仅供参考,具体以qPCR仪器的使用手册为准。
1、不需要ROX的机型:AgilentMX3000和MX4000、iCycler IQ、LightCycler 480、SmartCycler System、Thermal Cycler Dice RealTime System等型号的荧光PCR仪器不需要加ROX染料,但加入的话也不会影响整个PCR分析
2、需要使用ROXI的机型:ABIPrism7000、7300、7700、7900HT、Step One、Step One Plus。
3、需要使用ROXII的机型:ABIPrism7500、7500Fast、MJ Opticon、MJ Chromo4、CorbettRotorGene3000。
二、放入荧光PCR仪中进行扩增, 下表的扩增参数仅供参考,一定需要根据靶分子长度,引物和探针的Tm值、标记染料的种类等进行调节。一般选择三步法PCR:盖上盖子后上机,按下面参数进行RT-PCR:
步骤 反应参数 备注
逆转录(RT步骤) 50℃ 30 min
预变性 94℃ 2 min
PCR反应(45个循环) 95℃ 15 sec
60℃ 60 sec(采集FAM通道的荧光信号,淬灭基团为TAMRA)
三、数据处理
1.如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值,再推算出其浓度。如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性。一般情况下,阴性对照Ct大于或等于40(阈值需要以阴性对照的Ct值确定,此处为便于叙述以40为例,具体情况很可能阈值不一样)。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct值应该小于或等于30。对待测样品,如果其Ct大于或等于40则为阴性,如果小于或等于35则为阳性。如果在35-40之间,则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性,如果小于40,则为阳性。
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