CAT#:JW-931042-25
低温运输,-20℃保存
miRNA 染料法qRT-PCR试剂盒(polyA加尾法)
产品及特点
本试剂盒采用E.coli polyA聚合酶对miRNA加尾,然后用特异引物进行逆转录,最后用荧光定量PCR试剂盒进行定量检测,其原理示意图如下:
本产品具有下列特点:
1.两步法(加尾-逆转录、染料法qPCR),一步完成加尾-逆转录,然后检测多个miRNA靶分子。一次加尾-逆转录反应得到的cDNA可以做上百次PCR。
2.直接用总RNA为模板,不需要专门纯化miRNA,简单快捷。
3.检测灵敏度可以达到几百个拷贝/反应。
4.能区分有2-3个碱基不同的miRNA。
5.既可以定性,也可以定量。定量时线性范围至少有5个数量级,但需要自备标准品。
6.既可以用总RNA为模板,也可以用总miRNA为模板。
7.用户需要自备miRNA专一性的一条PCR上游引物。
8.本产品足够25次20uL体系的加尾和逆转录反应,100次20uL体系的染料法qPCR。
9.本产品只能用于科研。
规格及成分
成分 编号 规格 包装材料
加尾和逆转录Mix(含dNTP和ATP) 931042a 150 μL 0.5mL绿盖管
miRNA-polyA RT引物 931042b 干粉 0.5mL本色管
E.coli polyA聚合酶和M-MLV逆转录酶混合液 931042c 40 μL 0.5mL红盖管
miRNA PCR通用下游引物 931042d 干粉 0.5mL黄色管
2×SYBR PCR MasterMix 990408 1 mL 0.5mL棕色管
超纯水 980403 1 mL 2.0mL蓝盖管
使用手册 931042sc 1份 无
本产品使用十孔盒包装
注意:上表的两个引物用前需要加入30uL的超纯水充分溶解混匀后才可使用。
运输及保存
低温运输,-20℃保存,有效期一年。
自备试剂
总RNA、miRNA专一性上游引物(5pmol/μL in水中)
使用方法
一、设计、合成和分析自备的miRNA专一性上游引物
1.本试剂盒需要用户自行设计一条miRNA靶分子专一性的上游引物跟试剂盒提供的通用引物共同使用,用超纯水稀释到5pmol/μL待用。
2.miRNA专一性上游引物的Tm值决定后续PCR的复性温度,非常重要,故必须准确。可以通过网上的在线分析软件(如oligoanalyzer)计算Tm,但最好实验测定,做法是将100pmol miRNA专一性上游引物和等量的互补引物(不是下游引物)在20μL的本试剂盒提供的2×SYBR PCR MasterMix反应体系中混合(参考第9步,只是不加模板,其他成分都加),直接进行溶解曲线分析,测出在本试剂盒提供的反应体系中的Tm值。当软件计算的Tm值和实验测试的Tm值有差异时,以后者为准。
3.miRNA专一性上游引物最好在3端比miRNA短几个碱基。
4.可以选择一个所研究物种的5.8S rRNA作为内参,设计一条5.8S rRNA专一性的引物,同时做平行实验。
二、准备总RNA
5.用自选方法和试剂纯化总RNA,测定其浓度,最后用超纯水将其稀释到100ng/μL。总RNA样品中残留的DNA污染由于并没有下游通用引物(miRNA-polyA RT引物)的结合位点,所以一般不会干扰基于本方法的miRNA PCR检测。
三、加尾及逆转录反应
6.按下表设置RNA加尾和逆转录反应,以1个样品为例:
加入组分 体积
自备的总RNA,100ng/μL 2.0 μL
加尾和逆转录Buffer(含dNTP和ATP) 5.5 μL
miRNA-polyA RT引物 1.0 μL
E.coli polyA聚合酶和M-MLV逆转录酶混合液 1.5 μL
合计 10 μL
7.37℃保温1小时。
8.加入190μL超纯水使得总体积为200μL(稀释20倍),此样品将作为cDNA模板用于PCR。未用完的cDNA 20倍稀释样品可以放-20℃至少两年以上。
二、染料法qPCR
9.按下表设置染料法qPCR反应,最好每个反应设置3个重复:
加入组分 体积
2×SYBR PCR MasterMix 10 μL
自备Forward Primer,5pmol/μL 1 μL
miRNA PCR通用下游引物,5pmol/μL 1 μL
第8步所得miRNA cDNA 20倍稀释液 1 μL
超纯水 7 μL
10.建议反应程序设置如下:
循环 温度 时间
PCR
45次 95℃ 15秒
(miRNA特异引物Tm-5)℃ 15秒
72℃ 20秒
溶解曲线分析 根据PCR仪要求设定
11.分析溶解曲线分析所得Tm(在70-80℃之间一般表示扩增是特异的),分析Ct值,分析标准曲线的斜率和R2(如果用阳性对照做了标准曲线反应的话)。
关联产品
miRNA纯化试剂盒