CAT#:JW-231010
低温运输,-20℃保存
小鼠端粒长度检测试剂盒(染料法qPCR相对定量)
产品及特点
端粒是指真核细胞染色体末端独特的蛋白质-DNA结构,小鼠端粒由TTAGGG重复串联构成,长度约为30~50Kb。端粒对于染色体的稳定非常重要,其主要通过防止染色体降解及端端融合来维护染色体的稳定和功能。因为线形染色体的末端复制问题,细胞每次分裂,端粒逐渐减少,直到达到关键长度,此时细胞步入老化阶段。因此,外周血白细胞的端粒长度与年龄呈负相关,快速检测端粒长度具有重要的意义。本试剂盒根据染料法荧光定量PCR原理,在同一反应中同时检测端粒和一个单拷贝基因,根据两个扩增产生的荧光信号的比值来确定小鼠端粒的相对长度,其原理示意图如下:
它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供小鼠外周血DNA模板。
2.操作只需要半天,比Southern杂交检测法快3-5天时间。
3.使用PCR扩增,几乎每个分子生物学实验都有相关设备,非常方便。
4.准确检测各种起始量的模板,扩增稳定、定量结果具有高度重复性。
5.本产品足够50次20 μL体系的探针法荧光定量PCR反应。
6.本产品只能用于科研。
规格及成分
本产品采用十孔盒包装
成分 编号 规格 包装
2×SYBR qPCR MasterMix 231010a 1 mL 1 mL本色盖
RNase-free ddH2O 231010b 1 mL 1.5 mL蓝盖管
50×ROX(可选) 231010c 250 μL 1.5 mL棕色管
小鼠端粒引物(10 μM) yw231010 50 μL 0.5 mL棕色管
小鼠单拷贝内参引物(10 μM) ryw231010 50 μL 0.5 mL棕色管
使用手册 15-231010sc 1份 无
运输及保存
低温运输,-20℃避光保存,保存期限为一年。
自备试剂
样品DNA。
使用方法
一、SYBR qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
1.强烈建议每个样本做3次重复(定量实验至少需要3个生物学重复),按下表加入各成分:
成分 样品管 内参管
2×SYBR qPCR MasterMix 各10 μL 各10 μL
小鼠端粒引物(10 μM) 0.4 μL -
小鼠端粒内参引物(10 μM) - 0.4 μL
待测DNA样本(0.5-5ng/μL) 各1 μL 各1 μL
50×ROX(可选) 0.4 μL 0.4 μL
补超纯水到 20 μL 20 μL
注意:可根据选择的仪器在反应体系中加入ROX染料,将反应体系中的荧光信号标准化。下表为所列使用不同仪器操作时所需的ROX量(每50 μL反应体系):
仪器 每50 μL反应所需ROX量
ABI7300、7900HT、StepOne 5 μL
ABI7500、7500Fast、ViiA7、Stratagne Mx3000TM、
Mx3005PTM以及Mx4000TM 1 μL
Roche仪器、Bio-Rad仪器、Eppendorf仪器 无需添加
2.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
过程 温度 时间
预变性 95℃ 1分钟
PCR反应
(35-40个循环) 95℃ 10秒
55℃ 30秒
72℃ 45秒,采集(SYBR通道的荧光信号)
熔解曲线分析
四、数据分析
3.熔解曲线分析:熔解曲线分析用于判断扩增是否有效。如果得到Tm分别为81℃(端粒PCR产物)和80℃(内参PCR产物)的两个峰,则表示实验有效,可以进入下一步分析。如果没有同时得到这两个峰,则表示扩增为非特异性扩增,实验无效,不需要分析Ct数据,需要找到原因后再继续实验。
4.计算相对端粒长度:使用的2^-ΔΔCt法(Livak法)进行计算,得到T/S的比值作为端粒的相对长度。
对于端粒,ΔCq(端粒)是两个基因组DNA样本之间端粒的定量Cq值之差:ΔCq(端粒)= Cq(端粒,样本2)- Cq(端粒,样本1);
注意:ΔCq(端粒)的值可以是正数,0或负数。
对于单拷贝内参,ΔCq(单拷贝内参)是两个基因组DNA样品之间单拷贝内参的定量Cq值之差:ΔCq(单拷贝内参)= Cq(单拷贝内参,样本2)- Cq(单拷贝内参,样本1);
注意:ΔCq(单拷贝内参)的值可以是正数,0或负数。
ΔΔCq = ΔCq(端粒)- ΔCq(单拷贝内参)。
样本2/样本1的相对端粒长度(倍数)= 2^-ΔΔCq。
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