CAT#:JW-230431
低温运输,-20℃保存
人端粒长度检测试剂盒(染料法qPCR法)
产品及特点
端粒是指真核细胞染色体末端独特的蛋白质-DNA结构, 人类端粒由 TTAGGG重复串联构成, 长度为 5~15Kb。端粒对于染色体的稳定非常重要, 其主要通过防止染色体降解及端端融合来维护染色体的稳定和功能。因为线形染色体的末端复制问题, 细胞每次分裂, 端粒可减少20~200bp, 直到达到关键长度, 此时细胞步入老化阶段。因此, 外周血白细胞的端粒长度与年龄呈负相关,快速检测端粒长度具有重要的意义。本试剂盒根据染料法荧光定量PCR原理,在同一反应中同时检测端粒和一个单拷贝基因,根据两个扩增产生的荧光信号的比值来确定端粒的相对长度,其原理示意图如下:
它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供外周血DNA模板。
2.操作只需要半天,比Southern杂交检测法快3-5天时间。
3.端粒和内参的检测在一管内完成,误差小。
4.使用PCR扩增,几乎每个分子生物学实验都有相关设备,非常方便。
5.本产品足够50次20μL体系的探针法荧光定量PCR反应。。
6.本产品只能用于科研。
规格及成分
本产品采用十孔盒包装
成分 编号 规格 包装
2×Probe qPCR MasterMix 981201 0.5 mL 0.5mL本色盖
荧光PCR专用模板稀释液 180701 1 mL 1.5mL绿盖管
超纯水 210806 1 mL 1.5mL蓝盖管
人端粒和内参引物干粉 yw230431 50次 0.5mL棕色管
使用手册 15-230431sc 1份 无
注意:引物干粉在首次使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入 162uL 的超纯 水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为一年。阳性对照需要单独放置,不要污染其他试剂。
自备试剂
样品DNA。
使用方法
一、待测样品DNA的制备
1.如果有N个样品,最好设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。用自选方法纯化样品的DNA。用PicoGreen法或NanoDrop仪器对回收的DNA进行纯度测定和定量。纯度必须达到OD260=1.7-1.9。然后统一稀释到50ng/uL,每次PCR用3uL。
二、稀释标准曲线样品
2.如果有N个样品,任选一个样本来稀释,作为标准品。
3.标记5个离心管,分别标注为1-5号,分别对应模板浓度25 ng/uL、12.5 ng/uL、6.3 ng/uL、3.2 ng/uL、1.6 ng/uL、0.8 ng/uL。
4.用带芯枪头分别加入50 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头(下同)。
5.在1号管中加入50 μL 50ng/uL的阳性对照(第7步制备的N个样本中任选一个),充分震荡1分钟,得1号标准曲线样品。放冰上待用。
6.换枪头,在2号管中加入1号标准曲线样品 (上步稀释所得),充分震荡1分钟,得2号标准曲线样品。放冰上待用。
7.换枪头,在3号管中加入2号标准曲线样品(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得3号标准曲线样品。放冰上待用。
8.重复上面的操作直到得到5个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
三、SYBR qPCR反应(20μL体系,在样品制备室进行)
9.强烈建议每个样本做3次重复,N样本则需要做3N+5+1个PCR反应,多出的5个是用于标准曲线样本,另外一个是无模板阴性对照。按下表加入各成分:
成分 样品管3N个管 标准曲线样本5个 阴性对照
2×Probe qPCR MasterMix 各10 μL 各10 μL 10 μL
端粒和内参引物混合液 各3 μL 各3 μL 3 μL
待测DNA样本 各3 μL 不加 不加
标准曲线稀释液(1-5号) 不加 各3μL 不加
补超纯水 到20 μL 到20 μL 到20 μL
10.盖上盖子后上机,按下面参数进行PCR:
过程 温度 时间
第1步 95℃ 15分钟
第2步
2次循环 94℃ 15秒
49℃ 15秒
第3步
32次循环 94℃ 15秒
62℃ 10秒
74℃ 15秒,采集端粒扩增荧光信号
80℃ 10秒
88℃ 15秒,采集内参扩增荧光信号
第4步 熔解曲线分析
四、数据分析
11.熔解曲线分析:熔解曲线分析用于判断扩增是否有效。如果得到Tm分别为78℃(端粒PCR产物)和91℃(内参PCR产物)的两个峰,则表示实验有效,可以进入下一步分析。如果没有同时得到这两个峰,则表示扩增为非特异性扩增,实验无效,不需要分析Ct数据,需要找到原因后再继续实验。
12.制作标准曲线:以标准曲线样本浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制两条标准曲线,一条是用端粒的Ct值绘制,另外一条用内参的Ct值绘制。
13.确定待测样本浓度:通过标准曲线的公式,通过待测样本的端粒Ct和内参Ct,分别计算出样本中端粒的浓度和内参的浓度(ng数),再计算T/S值(即端粒浓度/内参浓度)。由于有三次重复,最后通过三个比值计算出每个样本T/S的平均值。
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