CAT#:JW-220325
低温运输,-20℃保存
酵母菌落PCR试剂盒
产品及特点
菌落PCR是筛选重组子的有效方法,可以使质粒鉴定过程从两天缩短到几小时。但如果宿主是酵母,其菌落PCR的难点则是破壁,因为酵母的细胞壁比 细菌坚韧许多。本产品是基于玻璃珠破壁方法而开发的酵母菌落PCR产品,它具有下列特点:
1.破壁效率高,甚至可以用于野生型酵母。
2.既可用酵母菌落,也可用酵母培养液。
3.条件温和,菌落PCR可以扩增长达3 kb的DNA。
4.既可小规模筛选,也适用于大规模筛查。
5.高灵敏度,既可用于扩增酵母质粒,也可以用于扩增酵母基因组DNA。
6.PCR反应液中含有惰性电泳染料,反应后可直接上样电泳,不需另加上样液。
7.处理过的酵母菌落样品低温长期保存后仍能用于PCR筛查。
8.本产品足够100次 60 μL体系的酵母菌落PCR(细菌菌落PCR需要用另一款产品,编号编号221139)。
规格及成分
本产品采用五孔盒包装
成 份 编号 规格 包装
酵母破壁液 220325a 2×1 mL 1.5 mL绿盖管
2×PCR MasterMix (菌落筛选专用) 11-220325b 2×1.5 mL 1.5 mL红盖管
酸洗玻璃珠400-600 μm 220126 3 g 2.0 mL本色管
使用手册 220325sc 1份 1份
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为一年。
自备试剂
酵母菌落,模版专一性引物,TE缓冲液。
使用方法
一、酵母破壁
1.如果有N个样本,则标记N+2个1.5 mL的塑料离心管,N个用于样本,
一个用于阳性对照PC(Positive Control,确认有质粒阳性的样本),一个
用于阴性对照NC(Negative Control,可以用水代替)。
2.在每个管中加入20 μL酵母破壁液。
3.挑入一个新鲜酵母菌落(芝麻大小即可)或2 μL酵母饱和菌液。
4.加入体积跟酵母破壁液相当的酸洗玻璃珠(重量在20-30 mg)。
5.涡旋震荡3分钟。
6.常温10000 rpm离心半分钟后可以直接取上清作为模板立即进行PCR。如
果不立即进行PCR,需将上清全部转移到新离心管中(至少可以取出15 μL), 再加入等体积的自备TE缓冲液,放-20℃待用。TE缓冲液中的EDTA可以抑制样本中残留DNase的活性,可以使DNA的放置时间更长。
二、PCR 扩增
7. 在一个 1.5 mL 的预冷塑料离心管中分别加入下列预冷成份并充分混匀 ,
得到PCR预混液并放冰上待用。由于有N+2个样本,所以配制时多加一个,
按 N+3 计算:
成份 N+2个样品管
自备超纯水 27 μL×(N+3)
自备PCR引物F,10 uM 1 μL×(N+3)
自备PCR引物R,10 uM 1 μL×(N+3)
2×PCR MasterMix
(菌落筛选专用) 30 μL×(N+3)
合计 59 μL×(N+3)
7.将上步得到的预冷PCR预混液按59 μL/管分装到N+2个标记并且预
冷的PCR管中。
8.将第6步制备的N+2个样品各取1 μL加入上步加有59 μL混合液的PCR
管中。PC样到PC管,NC样到NC管,1号样品加入到1号PCR管中,以
此类推。由于裂解液含大量PCR抑制物,样本用量不要超过1.5 μL,否则样本加得越多,PCR越容易被抑制。
9.将N+2个预冷的PCR管快速放入PCR仪器中进行扩增,PCR温度参数根
据引物和模板情况由客户自己预先确定。
10.PCR结束后直接取10 μL电泳直接进行琼脂糖电泳分析。本试剂盒提供的
PCR MasterMix(菌落筛选专用)中已经含有电泳示踪剂和促沉剂,故可以
直接上样。橙黄色电泳染料的泳动速度对应于50 bp的DNA,蓝色电泳染料的泳动速度对应于3-5 kb的DNA。
11.如果阴性对照NC有预期大小的扩增产物,则无论阳性对照PC和N个样
本的结果如何,整个实验无效。说明环境污染,需要解决污染问题再继续。如果阳性对照PC没有预期大小的片段,且没有任何样本呈现阳性,则很可能是试剂、程序、引物、仪器等有问题,需要解决问题后再继续。如果有任 何一个样本呈现阳性(不包括阴性对照),则实验有效,可以继续分析每个样品。
12.如果阳性对照有预期大小的片段,阴性对照没有,则整个实验有效。可以
分析每个样品。每个样品如果有预期大小的扩增产物,则初步判断为阳性。如果没有,则判断为阴性。
13.对阴性样本,可以用超纯水将其稀释10倍、百倍、千倍、万倍4个稀释度,
然后一起再进行 PCR 检测,如果某个稀释度的样本出现预期扩增产物,则测试时需要先将样本稀释到该稀释度后再测。
14.可以将阳性样品对应的菌落再挑出来进行培养并进行进一步的分析。
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