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核酸电泳染料(紫外光型)

点击次数:35次     发布时间:2025/8/26 17:04:13

CAT#:JW-220117-1.5
常温运输、4℃保存

核酸电泳染料(紫外光型)

产品及特点
目前最常见的替代EB的核酸染料SYBR Green I(属于花氰类染料)虽然毒性比EB低、灵敏度比EB高,但由于其化学稳定性差(怕光、怕水、怕热),实验结果的重复性差;此外,SYBR Green I在电泳过程中能在DNA分子间移位,使DNA条带模糊和扭曲,使得电泳清晰度和分辨率不如EB。所以在实际应用中依然不能有效替代EB。本产品是同时具有EB稳定性和SYBR Green I低毒性的新性核酸染料,其特点如下:
1.低毒。其主要成分未发现对人体有致癌性、未被列入有毒有害品,有利于保护使用者的健康和保护日益恶化的环境。
2.灵敏。检测灵敏度跟EB相当,能满足常规核酸电泳实验要求。
3.稳定。对光、水和热的稳定性跟EB相当,可加入琼脂糖凝胶中反复熔化。
4.无分子间位移现象。不会出现SYBR染料常见的条带模糊和扭曲现象。
5.使用方法多样。既可以加入熔化的胶中,也可以电泳后染色,还可用于PAGE。
6.跟各种常用的核酸电泳缓冲液(如TBE、TAE)兼容,但在TBE中背景最低。
7.观察时可以使用现成的观察EB的300nm UV紫外仪。
8.既可用用于DNA电泳染色,也可用于RNA电泳染色。
9.DNA或RNA浓度较高时还可以直接在日光下观察(需要将胶放在黑色背景下)。由于避免了UV对DNA的伤害,尤其适用于胶回收实验。
规格及成分
成份           
                                    编号       规格          包装
核酸电泳染料(紫外光型)        220117      1.5 mL    1.5 mL棕色管
使用手册           
                         220117sc    1份          无
本产品采用塑料袋包装

运输及保存
常温运输,4℃保存,有效期一年。

自备试剂
电泳缓冲液和琼脂糖凝胶

使用方法
注意:虽然本产品的主要成分未发现对人体有致癌性、未被列入有毒有害品,但操作时最好还是戴上塑料手套。
使用方法之一:电泳中染色DNA(RNA的染色跟DNA完全一样)。
本方法是将本产品直接加入溶化的凝胶中使用,只适用于琼脂糖凝胶电泳,不适用于PAGE。
1.将本产品直接加入到融化的琼脂糖凝胶中,每100mL凝胶加5 uL本产品(如果用TBE缓冲液)或电泳染色,混合均匀后倒胶。琼脂糖凝胶中不能含任何其他染料(如EB和SYBR Green I,否则会相互干扰)。注意:一定要保证琼脂糖彻底熔化,尤其是在第一次熔化胶的时候,否则未熔化的小颗粒将产生跟染料相同的荧光。
2.将DNA样品与DNA上样液按比例混合后上样。注意:一定要使用不含SDS等去污剂的上样液,否则SDS会跟染料结合,极大地降低灵敏度。
3.上样后电泳,电泳参数同常规的电泳。
4.电泳结束后在300 nm左右的UV下观察。注意:不要使用波长为260 nm或360 nm的UV,否则检测灵敏度会降低。如果DNA或RNA浓度较高,还可以直接在日光下直接观察(需要将胶放在黑色背景下),避免UV对DNA的伤害,尤其适用于胶回收实验。
注:显色结果:在紫外下,DNA浓度非常高的时候是白色,浓度低的时候是绿色的,单链核酸有时是红色的。
使用方法之二:电泳后染色DNA
本方法是在电泳后对DNA进行染色,适用于琼脂糖凝胶电泳和PAGE。但该方法需要单独的染色处理,染料用量较大,不推荐用于琼脂糖凝胶的染色。
1.按照常规方法进行电泳。
2.用去离子水将本产品稀释10000倍后(100 mL水需要加10 uL 本产品),将凝胶放入,室温下摇晃染色30分钟(对琼脂糖凝胶)或15分钟(对PAGE)。
3.用水脱色10-30分钟,具体时间需根据背景强弱决定,其余同方法一。
注意:电泳后染色液可以反复使用次数。

疑难解答
Q:本产品可否用于RNA染色?
A:可以,不论RNA是在甲醛变性胶中电泳,还是在普通的TBE或TAE胶中电泳,RNA染色后在300nm下都跟DNA一样呈绿色,
Q:本产品是否可以加入上样液中进行染色?
A:不行,本产品只能直接加入凝胶中进行染色或电泳后再染色。
Q:为何前端(靠近正极)的DNA条带很淡或根本看不见?
A:跟EB一样,电泳时本产品朝负极方向移动,当前端的DNA(最小片段)进入没有本产品的区域时,已经结合的染料分子会逐渐从DNA分子上脱落,所以条带会变淡或根本看不见。解决办法之一是缩短电泳时间或电泳后再染色;之二是在每100 mL电泳缓冲液中补加3-5uL染料。
Q:本产品在哪种缓冲液中效果最好?
A:在TBE中效果最好。如果使用TAE 100mL胶中加3-5 uL本产品就可以。
Q:为何电泳后前面部分(靠近正极)的胶呈白色,后面的胶呈黑色?
A:本产品带正电,电泳时往上走,胶的黑色部分是染料上移后留下的无染料胶。本产品在TAE中背景最强,可参考上个问题答案更换电泳液以降低背景值。
Q:用SYBR染色的DNA在电泳时为何容易发生条带模糊和扭曲现象?
A:SYBR染料一般与DNA的小沟结合,但在常规电泳条件下该结合并不牢固,染料分子可以在标记的和未标记的DNA分子之间转移,使DNA分子的泳动速度时快(无染料结合时)时慢(有染料结合时),发生条带模糊和扭曲现象。嵌入型染料(如EB和本产品)与DNA结合牢固,则无此现象。
Q:核酸染料是否都有毒性?
A:核酸染料对动物和人的毒性由多方面决定。一是染料的膜通透性,EB被归类为强诱变剂是由于其分子量较小,容易进入细胞内。而EB二聚体Ethidium Homodimer(EthD)嵌入DNA的能力比EB强上千倍,但毒性很小,就是由于其分子比EB大,不能透过细胞膜,所以毒性反而更低。SYBR系列染料虽然低毒,但由于一般都溶于DMSO(因为容易水解,不能使用水溶液做溶剂)中,所以如果溅到皮肤表面,更容易进入皮肤。二是染料是否容易被人体降解。比如EB在体外就很难降解,一旦进入体内能在人体内残留的时间可能比较长,增加了毒性;而SYBR Green I等染料(也能以嵌入方式与DNA结合)由于不稳定,比较容易自然降解,所以毒性自然较低。三是降解产物是否有毒性,比如用很多方法(如强碱法)降解EB得到的产物有的比EB毒性更大,而有的染料降解产物毒性却低很多,甚至无毒。四是染料进入细胞核以后是否能跟DNA结合,很多实验结果显示即使EB染料也很难嵌入型到染色体中,因为染色体中的DNA已经紧密地与各种组蛋白结合。五是细胞修复突变的能力,正常人体都有很强的修复突变的能力,如修复日光中UV诱导的DNA突变。总之,一种DNA染料的毒性强弱是多种因素综合的结果。

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