CAT#:JW-211237-30
常温运输和保存,有两个成分低温运输和保存
miRNA尿素-PAGE试剂盒
产品及特点
尿素-聚丙烯酰胺凝胶电泳(Urea PAGE)是目前分离200 nt以下的小片段RNA,尤其是20 nt左右的microRNA(miRNA)分子的主要方法,但是单独配制各种溶液十分繁琐,为此本公司开发了本产品。它具有下列特点:
1.一站式,含有电泳所需要的所有试剂,即开即用,十分方便,免去了实验人员称取有毒物品。
2.灵活,可以根据需要配制各种浓度的Urea-PAGE,以便对长度各异的RNA进行电泳。
3.电泳后可直接用于UV观察、银染、胶回收、Northern杂交等实验。
4.使用新型上样缓冲液,可以防止甘油的干扰。
规格及成分
本产品第一部分为大纸盒包装,常温运输
成份 编号 规格 包装
尿素 100873 105 g×2 250 mL本色瓶
丙烯酰胺,电泳级 211237a 60 g 125 mL棕色瓶
甲叉双丙烯酰胺,电泳级 100877 3 g 10 mL棕色瓶
TBE电泳液,10× 90313 250 mL 250 mL本色瓶
TEMED 110-18-9 1.5 mL 1.5 mL白盖管
过硫酸铵 100879 1 g 1.5 mL绿盖管
固相RNase清除剂 3090 250 mL 250 mL本色瓶
使用手册 211237sc 1份 1份
本产品第二部分为塑料袋包装。低温运输
成份 编号 规格 包装
2×miRNA尿素-PAGE上样液 970608 1.5 mL 1.5 mL红盖管
miRNA电泳分子量标准(15-50 nt) 220154 150 μL 1.5 mL蓝盖管
运输及保存
常温运输和保存,其中miRNAon、miRNA Marker需要低温运输,-20℃保存,保存期一年。
自备试剂
miRNA样品、RNase-free水。
使用方法
1.准备工作:用固相RNase清除剂清洁工作平台
直接将固相RNase清除剂原液或10倍的新鲜稀释液喷于台面,5分钟后用普通吸水纸擦净,最后用沾有固相RNase清除剂1000倍新鲜稀释液的吸水纸擦净,晾干。
2.准备工作:用固相RNase清除剂清洁玻璃和塑料器皿将器皿浸泡在固相RNase清除剂的10或100倍的新鲜稀释液中,静置处理5分钟后取出,再用固相RNase清除剂1000倍或10000倍新鲜稀释液浸泡二次以上,倒立晾干后备用。
3.配制1×TBE电泳液:将适量的10×TEB电泳液用RNase-free水稀释10倍,得到1×TBE电泳液待用。此溶液需要现用现配,否则易长菌。
4.配制10%过硫酸铵溶液:精确称取约100 mg过硫酸铵到一干净的1.5 mL离心管中,按每1 mg过硫酸铵加10 μL RNase-free水的比例加入RNase-free水,摇晃溶解待用。10%过硫酸铵溶液有效期不要超过一周。
5.估计所需要的凝胶溶液的体积,一般配制一块13 cm×15 cm×0.8 mm的胶需要15 mL凝胶溶液,配制一块36 cm×45 cm×0.8 mm的胶需要120 mL凝胶溶液。
6.配制40%的丙烯酰胺-甲叉双丙烯酰胺溶液:将3 g甲叉双丙烯酰胺全部倒入装有60 g丙烯酰胺干粉的瓶中,加入130 mL自备的RNase-free水,充分摇晃混匀即得40%的Acrylamide/Bis(20:1)溶液。
7.根据所需要的凝胶溶液的体积,在一的干净的三角瓶中按下表加入各成分(此处以配制100 mL Acrylamide/Bis终浓度为15%的凝胶为例):
成份 终浓度 用量
尿素 7 M 42 g
40%Acrylamide/Bis溶液 15% 37.5 mL
10×TEB电泳液 1× 10 mL
补RNase-free水到100 mL
注:Acrylamide/Bis的终浓度需要根据待分离RNA长度选择(见下表)。
需分离的RNA长度范围 Acrylamide/Bis终浓度
6-100 nt 20 %
25-150 nt 15 %
40-200 nt 12 %
8.搅拌并加热到40-50℃左右,直到尿素完全溶解。
9.冷却到室温后,将三角瓶接上真空系统抽真空处理10-15分钟以充分去除溶液中的氧气(氧气会降低聚合反应效率)。若条件有限,此步可省略。
10.边摇晃溶液变加入50 μL TEMED和500 μL10%过硫酸铵溶液。注意:如果选择其他工作浓度的Acrylamide/Bis,此二成分的用量不需要随之改变。但如果配置的凝胶溶液的体积变化,此二成分的用量要按比例改变。
11.再充分摇晃约30秒后迅速灌胶,然后插入样品梳,室温放置30-60分钟等待胶凝固。
12.将凝胶板放置在电泳装置上后,在上下层分别加入适当量的1×电泳缓冲液。如果不马上使用,需要有湿纸将上样孔端盖住以防凝胶过度干燥。
13.拔出梳子后用加样枪吸取电泳缓冲液,充分将每个加样空中未聚合的Acrylamide/Bis、尿素和气泡吹打出来。
14.在上样前,预电泳20-30分钟以使多余的过硫酸铵跑出加样空,同时还可以使凝胶的温度升高(到50℃左右),有利于RNA变性状态。
15.将5 μL miRNA样品与和5 μL miRNA电泳分子量标准(15-50 nt)分别和5 μL的2×miRNA上样液混合,70℃保温2-3分钟后迅速放置在冰上冷却,快速离心半分钟,放冰上待用。可以增加miRNA样品的用量,但上液需要等比例增加。
16.关电泳仪后开始上样。10 μL混合液需要全部上样。
17.重开电泳仪,对13 cm×15 cm的胶,以20-30 mA的电流电泳,直到红色染料移动到凝胶边缘为止;对36 cm×45 cm的胶,则以50-60 mA的电流电泳,直到红色染料移动到凝胶边缘为止。
18.染色观察:将凝胶一面的玻璃板揭开,直接用仍然附着在另一玻璃板上的凝胶进行各种染色,包括银染(需单独购买试剂盒)、EB染色(每100 mL 1×TBE中加20 μL 10 mg/mL的EB溶液)、克必隆低毒核酸染料染色(每100 mL 1×TBE中加10 μL低毒核酸染料)。如果用后两种染色法染色,需要在UV下观察并拍照。本产品提供的miRNA Marker有5条带,从上到下的长度分别为:50 nt、40 nt、30 nt、20 nt和15 nt。
19.其它后续处理(本试剂盒不含所需试剂),流程仅仅供参考。
miRNA回收:在UV下确定所需要的miRNA条带的位置,切胶后进行胶回收处理(需要单独购买试剂盒)。
Northern杂交:UV观察后将凝胶中的RNA电转移到带正电的尼龙膜上,然后进行杂交处理。
放射自显影:如果miRNA样品电泳前经过同位素标记,则将凝胶一面的玻璃板揭开,用滤纸将附着在另一玻璃板上的凝胶吸附过来,然后包上保鲜膜,真空抽干,然后使胶跟X光片向对置进行放射自显影。
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