CAT#:JW-19-2029
低温运输,-20℃保存
夜来香花叶病毒、黄瓜花叶病毒及烟草花叶病毒三重探针法qRT-LAMP试剂盒(不含内参)
产品及特点
夜来香花叶病毒(Telosma Mosaic Virus, TelMV)属于马铃薯Y病毒属,基因组全长9689 nt;烟草花叶病毒(Tobacco Mosaic Virus, TMV)属于植物杆状病毒科烟草花叶病毒属,基因组全长为6395 nt;黄瓜花叶病毒(Cucumber Mosaic Virus, CMV)属于雀麦花叶病毒科、黄瓜花叶病毒属;它们都是正义单链RNA 病毒。TelMV寄主范围相对较广,能侵染夜来香、印尼广藿香、翅果铁刀木和西番莲,并广泛分布在东亚和东南亚国家,主要表现为花叶,导致广藿香叶片产量和叶片中的油含量迅速下降。CMV侵染植物产生的症状随寄主的改变而改变,常见的症状有花叶、皱缩、黄化和植株矮化,还有系统坏死等。TMV主要通过汁液摩擦传播,同时也通过蚜虫、土壤以及种子传播,主要是侵染烟草时表现出黄绿相间的花叶症状,严重时形成疱斑。TelMV、TMV及CMV对农业生产造成巨大危害,因此快速灵敏诊断TelMV、TMV及CMV具有重要意义。为此本公司以探针法qRT-LMAP技术为基础,开发了TelMV、TMV及CMV的qRT-LAMP三重检测试剂盒,它具有下列特点:
1.即开即用,用户只需要提供病毒RNA样品。
2.恒温扩增,反应设置更加简单。
3.含荧光探针,可以对扩增进行实时荧光检测(需要荧光PCR仪)。
4.检测灵敏度一般比RT-PCR高10倍以上。
5.特异性高,引物是根据TelMV、TMV及CMV的RNA序列保守区域设计的,不会跟其他其他生物的RNA发生交叉反应。
6.一般30分钟内出结果,比qRT-PCR快。
7.提供无传染性的阳性对照,便于分析实验结果。
8.上样量大,对20 mL的反应体系,最大样品加样量高达到14 mL。
9.内含的dUTP-UNG可防交叉污染。
10.本产品足够50次20 mL体系的探针法qRT-LAMP扩增。
11.只可用于科研。
规格及成分
本产品采用五孔盒包装
成份 编号 规格 包装
RT-LAMP MasterMix(探针法待加酶) 220305a 200 mL 0.5 mL本色盖
逆转录酶-扩增酶混合液 220305b 100 mL 0.5 mL红盖管
20×TelMV、TMV及CMV探针法qRT-LAMP引物-探针干粉 yp19-2029 50次 0.5 mL白盖管
TelMV、TMV及CMV
阳性对照(1E7拷贝/mL) pc2029 250 mL 0.5 mL黄盖管
荧光PCR专用模板稀释液 180701 1 mL 1.5 mL绿盖管
使用手册 19-2029sc 1份 1份
注意:引物干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入55 mL的超纯水充分混匀和再使用,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存
低温运输,-20℃保存,保存期限为一年。
自备试剂
待测样品。
使用方法
一、稀释标准曲线样品(以1E1-1E6拷贝/mL这6个10倍稀释度为例)。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原,本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供无传染性的RNA片段作为阳性对照。如果需要RNA阳性样品,需要另外订购。
1.标记6个离心管,分别为6、5、4、3、2、1。
2.用带芯枪头分别加入45 mL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头,下同)。
3.在6号管中加入5 mL 1E7拷贝/mL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1E6拷贝/mL的标准曲线样品。放冰上待用。
4.换枪头,在5号管中加入5 mL 1E6拷贝/mL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E5拷贝/mL的标准曲线样品。放冰上待用。
5.换枪头,在4号管中加入5 mL 1E5拷贝/mL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E4拷贝/mL的标准曲线样品。放冰上待用。
6.重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
7.用自选方法纯化样品RNA,本试剂盒跟市场上大多数RNA提取试剂盒兼容,包括本公司的免提取的核酸释放剂。
8.如果有N个样品,则需要做N+2个样品制备,包括一个样品制备阳性对照(PC)和一个样品制备阴性对照(NC)。PC用10 mL本试剂盒提供的阳性对照(1E7拷贝/mL)加一定量的水充当,总体积必须核酸纯化试剂盒所要求的起始样品体积一样,NC用水替代。
三、探针法qRT-LAMP反应(20 mL体系)
9.注意:第一次使用一个新的试剂盒时,必须先将100 mL逆转录酶-扩增酶混合液全部加入到qRT-LAMP MasterMix(探针法,待加酶)中,盖上盖子后轻柔颠倒1分钟混匀,然后再取用。如果只做1次重复,则标记N+9个RT-LAMP管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于RT-LAMP阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。
10.反应设置:如果有N+2个RNA纯化样品,则最好设置N+4个qRT-LAMP扩增,增加qRT-LAMP阴性对照和qRT-LAMP阳性对照各1个。在N+4个qRT-LAMP个管中加入下列成分:
成分 N+2个样品管 qRT-LAMP 阴性对照 qRT-LAMP阳性对照
qRT-LAMP MasterMix
(探针法,加酶后) 各6 mL 6 mL 6 mL
20×TelMV、TMV及CMV探针法qRT-LAMP引物-探针混合液 各1 mL 1 mL 1 mL
N+2个样品RNA 各13 mL - -
超纯水 - 13 mL -
TelMV、TMV及CMVqRT-LAMP
阳性对照(1E7拷贝/mL) - - 13 mL
11.本产品必须使用荧光PCR仪器进行扩增。设置60次循环,每次循环65℃保温1分钟,采集FAM通道的荧光信号。
四、结果分析
12.若只判断阳性或阴性,则阴性对照Ct值必须没有读数,或者大于或等于40。样品制备阳性对照和qRT-LAMP阳性对照必须有荧光对数增长,有标准的S扩增曲线,Ct值应该小于40。样品制备阴性对照和qRT-LAMP阴性对照Ct值必须没有读数、大于或等于40,如果小于40则为阳性。如果阳性和阴性对照结果正常,则实验有效,可以分析样品的情况。
13.若把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再推算出其浓度。
关联产品
TelMV、TMV及CMV荧光定量RT-PCR试剂盒